En mi PC se abrió una ventana de repente de Símbolo de Sistema que decía algo de una transacción pero no alcance a ver porque se

Si fue muy rapido, puede haber sido una actualización Para descartar "intrusos" ejecuta tu antivirus habitual, que realice un escaneo de tu ordenador. Si no aparece nada, perfecto, pero yo realizaria otro escaneo con un antivirus online como el ESET (http://eos.eset.es/) o con el PANDA (http://www.pandasecurity.com/activescan/index/ ). Si no aparece nada, yo estaria tranquilo.