Plazo para responder un Recurso de Alzada

Interpuse el 2 de agosto de 2011 un recurso de alzada contra una resolución sancionadora sobre mi persona. Teóricamente, el plazo que tiene el Ministerio de Interior para responderme es de tres meses . Hoy día 31 de Agosto de 2012 he recibido una resolución donde se desestima el recurso, pero claramente la Administración ha contestado fuera de plazo. No se como proceder ahora ya que agotada la vía administrativa, lo siguiente sería el contencioso.

Muchas gracias de antemano