Autónomos, iva y retención

Voy a ponerme de autónomo por primera vez. Me van a hacer contrato mercantil. Me dice la empresa que voy a tener una retención del 7% por no haber sido antes autónomo, y me dicen que el importe que me pagan no tiene Iva. Y que de los gastos que tenga puedo desgravar el iva correspondiente. No sé si es correcto esto que han contado