Ademanes femeninos en niño de 9 años

Tengo un sobrino de 9 años que en ocasiones hace ademanes afeminados, llora fácilmente cuando se le reprende, cuando alguien le habla con seriedad aún sin regañarlo, le gusta dormir con sus peluches y le molesta que le digan que alguna niña está interesada en él. Por otro lado, le fascina spiderman, los videojuegos, la natación, y jugar con niños de su edad.
Mi hermano se enoja mucho - casi como si fuera homofóbico - justo hoy le prohibió la amistad de un compañero de clases que un día le regaló un osito con un corazón; le pidió a su esposa que tirara todos sus peluches y le dijo que hablara con él.
Yo le pedí que por favor reflexionara sobre la amistad con su amiguito, que si bien no nos consta que sea homosexual, afeminado, etc., es igualmente respetable y que asumiendo que sea homosexual, es poco probable que esté interesado en mi sobrino, tal vez sólo está agradecido porque él no lo juzga, lo respeta y lo aprecia. Con respecto a sus peluches, también le dije que no me parece que al quitárselos, mi sobrino se vuelva más varonil o se vuelva heterosexual - si no lo fuera. En fin, que yo más bien le sugerí que pase más tiempo con él, conociéndolo, platicando, y que le manifieste que sin importar sus preferencias sexuales, decisiones profesionales, etc., él lo ama, LO RESPETA, lo apoya y tratará siempre de ayudarlo cuando se lo pida. Me mandó por un tubo! Es decir, que me dijo que era su hijo y él sabía cómo manejarlo.
Aún con esta respuesta, yo quiero ayudar a mi sobrino, puede ser que se comporte así, por algo que le está incomodando, hiriendo, molestando; tal vez es afeminado, homosexual o simplemente es un niño que se está auto conociendo y no sabe cómo expresarlo... Lo que sea, quiero que él sepa que no lo juzgo, que lo amo tal y como es y que lo respeto y quiero apoyarlo en lo que él necesite.
Pregunta: ¿Cómo debo acercarme a él con este tema? ¿Qué preguntas debo o no hacerle? ¿Debo insistir? ¿Cómo lo ayudo sin contrapuntear las órdenes de su papá?