Empadronamiento diferente a mujer e hijos. ¿Posibles problemas?

Hasta hace unos meses he vivido y trabajado en mi localidad de toda la vida, llamemosle A, pero me independicé y al tener familia cambié mi empadronamiento a otra localidad, llamémosle B. Al hacer esto el médico que tenía antes cambió al de la localidad B.

El problema es que por el trabajo paso todo el dia en mi localidad natal, A. Sólo voy a casa a B a dormir. Es por eso, que para volver a poder tener mi médico de toda la vida tendría que volver a empadronarme en la localidad A.

Si hago esto la pregunta es. ¿Sabéis si el estar empadronado en otro pueblo (A) al de mi mujer e hijos (B) podría tener algún problema de cara a solicitudes, papeleos o temas legales... O cualquier otra cosa a posteriori?