Hacienda me reclama casi 18.000€ por unas acciones que vendí por 1000€

En el 2013 vendí por 1000€ unas acciones de una empresa, era el valor que tenían en escrituras, ahora hacienda me reclama cerca de 12.000€, porque en el impuesto de sociedades del patrimonio neto era de 480.000€ más menos. ¿Cómo me pueden reclamar ese dinero si yo solo cobre 1.000€?. Y que puedo alegar, ya que según ellos el valor era de 53.000, pero yo solo cobre los 1.000€.