Baja por embarazo enfermedad común

Estoy en la semana 34 del embarazo. Trabajo de oficina con toda la jornada sentada y cogiendo expedientes entre 5-10kg. Empecé a tramitar la documentación para cuando me dieran la baja por la mutua. En la primera visita me dicen que es un trabajo sin riesgo y le explicó lo de la carga de peso y las horas sentadas por lo que me encuentro incómoda, sigue insistiendo en que no hay riesgo. Le entregó un papel en el que la ginecóloga me recomienda reposo porque se me puede adelantar el parto y que he tenido la tensión alta y me derivan a la seguridad social porque dicen que es una patología y no se hacen cargo ( me comenta en ese momento que si no le llego a dar el papel me hubiera dado la baja). Me voy al de cabecera y me da la baja por enfermedad común y en la descripción me indica amenaza de aborto. Me gustaría un poco de asesoramiento para saber qué tengo que hacer, ¿la prestación y cuándo me pagan el 100%?