Comencé a planificar y tengo un flojo marrón

Empecé a planificar por primer vez el 15 de Marzo que me llego el periodo, el cual duro hasta el 19 de Marzo, (aclaro mi periodo siempre ha sido regular) el 21 de marzo empezo para mi lo que me ha parecido terrible, flujo marron todo este tiempo el cual no se me ha quitado he tenido que usar tampones todos este tiempo ya que si uso protectores no me aguanto la picazon que considero yo genera el flujo, segun mi calculo me llega el periodo el 14 de abril, ¿y el 15 de abril plicarme nuevamente la inyeccion deseo saber que va a pasar con mi periodo y ese flujo marrón es normal? No he tenido relaciones sexuales ya que la doctora lo recomendó hasta dentro de un mes, por otro lado los senos me duelen terriblemente.