Php - Bases de Datos

Hola buenas tardes.
Tengo tiempo programando en Visual FoxPro, por lo cual no se me hace tan difícil entender el código de Php, lo que no he podido entender hasta ahora, ya que quiero empezar poco a poco a desarrollar aplicaciones Web con Php. ¿Es dónde tengo que guardar mis script de Php y donde tengo que guardar miy Base de Datos con sus Tablas (MySql) a la hora de probar mi aplicación web...?
* Instale todo utilizando AppServ
Saludos y gracias de antemano