¿Flujo marrón vaginal intermenstrual?

Buenos días,
Llevo tomando las pastillas anticonceptivas Yaz unos 6 meses. He llegado a mantener relaciones sexuales sin que el chico eyacule dentro de mi y la regla me llega regular todos los meses.
Este mes de julio mantuve relaciones el día de mi octava pastilla. El día de mi décimosexta pastilla tuve diarrea pero como fue a las 6 horas de la ingesta diaria de la pastilla no tomé otra puesto que mi cuerpo ya la habría asimilado.
Llevo tres días manchando un flujo marrón color café y no se a qué se debe.
Cabe decir que me tomo las pastillas todos los días a la misma hora de una forma muy estricta. No he olvidado ninguna este mes, ni me he retrasado en la toma de alguna.
Cabe decir también que padezco ovarios poliquísticos y que desde hace mucho tiempo padezco ardor, picor, comezón y flujo amarillento espeso y abundante en algunas temporadas.
Espero su respuesta.
Gracias y disculpe por las molestias.