Flujso marrones

Buenos días, mire tengo una consulta estoy en un tratamiento porque tengo sindrome del ovario poliquistico y quiero tener un bebé,así que estoy en tratamiento desde hace 4 meses tomando glucofage, progesterona y ácido fólico estos dos meses me han venido flujos marrones cuando se supone debe venir la regla normal, ¿a qué se debe? Gracias