Solicitar la devolución del IVA .

Durante algo más de 2 años he trabajado en regimen de RETA para una administración autonómica. Resulta que por una inspección de trabajo se obliga a esta administración a darme de alta como trabajador en regimen general. Mi pregunta es si de los contratos mantenidos con la administración puedo solicitar el IVA que me correspondia a mi pagar.