Duda sobre facturación e IVA a extranjeros

La empresa es una AC, con fines no lucrativos, se aperturó con la finalidad de obtener fondos para la realización de un congreso mundial de médicos con sede en México que será el próximo año, actualmente se están recibiendo suscripciones de gente de todo el mundo por lo cual se cuenta con un sistema por internet que al hacer los extranjeros su llenado de formato, se les genera un recibo (no factura) en dólares como comprobante, que para los extranjeros es suficiente. No así para los médicos mexicanos a los cuáles se les ha facturado por medio de la facturación digital CFD.
Qué debo hacer con los clientes extranjeros, les tengo que elaborar también su factura digital?, y desglosarles el iva de la cuota que ya pagaron?
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