Necesito ayuda con el itp y ajd

Hola buenas tardes!
Me dirijo a usted porque tengo un problemilla con el impuesto de transmisiones patrimoniales. Lo que me a pasado es lo siguiente:
¿El pasado 04/01/2008 adquirí una vivienda por importe de 61.116,40? ¿Con lo cual tuve que pagar el impuesto de transmisiones patrimoniales y actos jurídicos que ascendía a la cantidad de 3.317,58? (Esta cantidad sale de: 69.116,40 x 6%= 4.146,98 - 20% de bonificaciones) Esto lo pagué el 28/01/2008.
¿Cuál es mi sorpresa, que el día 10-04-2008 me llega a mi domicilio una carta certificada del Registro en la cual me pueden 1.136,74? Del ITPY AJD. Visto esto, me fui al Registro allí me dijeron que lo que había pagado (¿los 3.317,58?) No era lo que me correspondía de pagar, ¿puesto qué "ELLOS" dicen que mi vivienda no me a costado 61.116,40? ¿Sino qué me a costado 92.563,07?. ¿Tengo qué señalar que en mis escrituras está el pagaré por importe de 69.144,40? ¿A nombre del vendedor y que en las escrituras el valor fijado de la vivienda es 69.114,40?.
Señor estoy indignada. ¿Por qué tengo que pagar un impuesto de algo que no me corresponde? ¿Podría usted ayudarme ha hacer un recurso?
Por favor, si alguien puede ayudarme con este tema que me comente algo.
Gracias de antemano,

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