Disco duro no detectado

Hola!!!! Tengo un problema, a ver si me puedes ayudar!! Tenia el ordenador hacho un asco y decidí formatearlo. Me a costado bastante puesto que he tenido problemas con el lector de CD-S. Te explico: Quería formatear el ordenador con el típico CD de arranque. Pues bien, el ordenador no me detectaba la unidad de CD. He dado mil vueltas y al final ha resultado ser que tenia el cable de conexión un poco suelto, lo metí y por fin he podido formatear el ordenador!!!! Hay que decir que antes de esto(poner el cable bien) e enredado mucho en BIOS y es posible que tenga algo cambiado y que de hay venga el fallo. Lo raro es que al formatear me detecta los dos discos duros y me da la opción de en cual instalar windows, instala normal, pero luego en "Equipo" solo aparece uno. Espero haberme expresado bien, cualquier duda, me dices!!! Muchas gracias de antemano!!!!