¿Qué pasa si cambio el atributo de un archivo en mi proyecto?

He realizado el escaneo de vulnerabilidades a mi sitio web y en el resultado se muestra un vulnerabilidad de riesgo bajo, la solución sería eliminar el archivo en donde se detecto la vulnerabilidad o cambiar los permisos de dicho archivo, en mi caso no puedo eliminarlo lo que puedo hacer es cambiar los parmisos de dicho archivo, al cambiar dichos permisos y activar la casilla de "read only", ¿puede pasar algo al momento de ejecutar nuevamente mi aplicación? ¿Y además resolverá mi vulnerabilidad?.

Muchas gracias, en el caso de que la pregunta no esté clara muchas gracias por los comentarios.