Flujo marrón por dos semanas, ¿Qué puede ser?

Empecé con pastillas anticonceptivas el 1ro de noviembre, es la primera vez que tomo pastillas.
Antes de empezarlo utilizaba varias veces la pastilla del día después (al menos una vez cada una o dos semanas) puesto que no usaba condón.
Mi menstruación fue el 29 de noviembre al 4 de diciembre todo normal, el 5, 6 y 7 de diciembre tuve relaciones y sangré un poco solo el día 5, después los otros días normal.
El 11 me empezó un flujo marrón sin olor ni molestia alguna solo el flujo en poca cantidad, pero mi duda es que llevo desde el 11 hasta hoy 21 con ese flujo y quisiera saber a que se debe, si debo ir al médico o si es por las pastillas anticonceptivas, ¿puesto qué apenas es mi 2do mes?
Y la otra duda si hay una manera de detenerlo, no es molesto, como dije es en poca cantidad sin olor desagradable y sin ningún dolor, pero soy activa sexualmente y en ese caso si me molesta.