¿Puedo tomar antibióticos después de 4 días de haber aplicado el método juzpe?

El domingo pasado tuve que realizar el método Juzpe como anticonceptivo de emergencia. El día siguiente, el lunes empecé con unos dolores extraños hasta que me di cuenta que era cistitis, el martes ya habían desaparecido los sintomas, hoy jueves vuelven los dolores, el problema es que no he tomado ningún antibiótico por miedo a neutralizar las pastillas ingeridas. ¿Quiero saber si existe algún riesgo de que las pastillas pierdan su efecto y quedar embarazada al tomar antibiótico para aliviar el dolor de la infección?

Las relaciones las tuve el sábado en la noche y las pastillas me las tomé al día siguiente a las 11am