Factura REBU con entrega vehículo usado

Tengo que hacer una factura por la venta de un vehículo en el REBU y del precio de compra se descuentan 2000 porque el comprador da un vehículo de su propiedad, ¿cómo tendría que reflejar esta entrega en la factura? Porque al aplicarse el IVA por el margen de beneficio si no se incorpora el vehículo el margen es muy alto