Te pediría que aclararas más tu pregunta porque no la entiendo. El JDK es el conjunto de clases que se proporcionan en la distribución de java. Cuando tu compilas un código java se genera un archivo .class que no es directamente ejecutable ya que si no conoces las características de Java has de saber que el código Java se traduce en el momento de ejecutarlo para así poder correr un programa en cualquier sistema sin tener que recompilarlo. No se si es esto lo que querías saber.
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