Dotación por impago

Buenas tardes, en 2013 hice un trabajo de una obra de construcción, y emití la factura con fecha de enero 2014. Se puso como fecha de pago noviembre de 2015, y se hizo un documento ante notario, que si llegado el momento no me pagaba, podía quedarme con uno de sus bienes, en concreto un duplex de su propiedad. Mi pregunta es, la factura emitida por mi SL, hay alguna manera de que no tribute en el impuesto de sociedades 2013, ya que no la he cobrado y me parece injusto. La he declarado en el primer trimestre de 2014 sin IVA ya que es por inversión del sujeto pasivo. Habría sido suficiente con no emitir la factura o no me quedaba otro remedio?

Gracias