Factura compra de vehículo

Buenas tardes,
Soy autónomo, y compré el pasado 1 de abril un coche para afectarlo dentro de la actividad de mis servicios. Cuando estuve negociando con la entidad de compraventa de vehículos siempre les indiqué la intención de afectar este bien a la sociedad para desgravarme el iva (50%). Cuando fui a recoger el vehículo, me indicaron que no tenían preparada la fra, y que me la enviarían junto a la documentación de cambio de propiedad. A los 26 días de no tener información, les reclamo la fra y me la envían vía mail como operación sujeta al régimen especial de bienes usados, por lo que no desglosan el iva. Lógicamente me quejo, porque tengo entendido de que es potestad del vendedor el poder aplicar o no el régimen especial bajo su criterio, y les indico que me parece que han actuado de mala fe, ya que yo siempre les indiqué que estaría afectado en una actividad empresarial. De hecho, si me ubiesen entregado la fra cuando recogí el vehículo sin el iva me habría retractado en la compra.
Pregunta: ¿Hay alguna manera de poder desgravarme el iva correspondiente?
Muchas gracias por su ayuda