Prioridad en el pago por una entidad bancaria

Buenos días: Mi empresa se encuentra en la siguiente situación con una entidad bancaria. Tenemos financiaciones de exterior vencidas que estamos renegociando para tratar de convertir en deuda a largo plazo. Por otro lado tenemos pagarés emitidos que hemos venido atendiendo sin ninguna incidencia. Ahora la entidad nos llama y nos dice que aunque pongamos el dinero, no va a atender el pagaré sino que lo va a usar para minorar la deuda de exterior que tenemos con ellos. ¿Pueden decidir ellos a que aplicar el dinero que tú metes en su entidad para otro concepto? ¿Es decir, si yo meto dinero en la entidad, con claras instrucciones por escrito de que es para atender el pagaré, ellos pueden coger ese dinero, minorar la deuda de exterior y no atender el pagaré?

Muchas gracias.