Dolor en la rodilla solo al caminar y correr

Desde hace tres semana me empezó a doler la rodilla sin motivo alguno. Hago ejercicio pero no excesivo ni tampoco he tenido golpes ni nada. Lo raro es que si puedo agacharme y doblar la pierna. El dolor comienza al caminar o al querer correr. Fui al doctor y me dijeron que era por caminar mal o por usar zapato plano y solo me recetaron paracetamol y naproxeno y reposo por 3 días. Ya paso semana y media y aún continua el dolor! Que puede ser?