¿Cómo se calcula la base de cotización por vacaciones al finalizar un contrato fijo discontinuo?

Mi pareja tiene un contrato fijo discontinuo de servicios tipo 300 en una escuela por una empresa de servicio de comidas, al finalizar el curso finaliza el contrato y siempre les cotizan las vacaciones no disfrutadas a parte, pero con una base muy inferior a la que tienen por día trabajado, pues cobran y cotizan por día trabajado y horas, que todos los días de trabajo son iguales. Por lo que veo salen pendiendo, primero por lo que no cobran y después por que han dejado de cotizar para la base del desempleo. Que podemos hacer ??