¿Pueden regularizarte el irpf y quitarme la paga?

Hola buenas
Haber llevo trabajando en mi empresa desde el día 8/01/2008,
tengo un contrato temporal y me quitan de irpf un 2%, eso me han quitado desde el primer mes asta ahora, entonces si regularizan el irpf de este año, ¿en teoría tendría que ser más alto no? La empresa quiere regularizarme el irpf y descontármelo de la paga extra de navidad... ¿pueden hacerlo?
Gano unos 17000 euros brutos al año...
Gracias por ayudarme