Certificado de retenciones e ingresos. Mi empresa me ha puesto 2000€ en dietas quitándomelos del importe íntegro satisfecho

Mi empresa me ha entregado el Certificado de retenciones e ingresos a cuenta del Impuesto sobre la Renta de las Personas Físicas. En éste aparece un importe satisfecho de 2.000€ en el apartado de "Dietas exceptuadas de gravamen y rentas exentas del impuesto", pero no tengo ningún tipo de dieta ni asignación para gastos de viaje ni aparece nada de esto en mis nóminas. Es decir, este importe de 2.000€ me lo han restado del importe íntegro satisfecho del apartado de retribuciones dinerarias.

Me gustaría saber si esto me perjudica en la declaración de la renta, o si me podría perjudicar a la hora de una indemnización por despido o prestación por desempleo.