¿Reforma terminada y después de tres semanas se cobra?

Soy autónomo y le he hecho una reforma a una empresa la cual nos ha retrasado con sus cambios y demás, una vez terminada la obra todo son pero para cobrar que si un azulejo suena hueco, que si esta sucio, y así millones de cosas más, sin haber cobrado limpieza hemos tenido que hacerla y ahora a la hora de cobrar, quieren poner sus condiciones, podrían denunciarme por alguna razón, no tenemos contrato tan sólo un presupuesto firmado, ¿y yo que podría hacer para cobrar mi dinero?