Montar empresa de casas rurales en Internet

Hola,
por tú pregunta entiendo que tienes intención crear una central de reservas en la que te encargarías de realizar las reservas para los alojamientos y cobrarías por ello.  Este cobro se puede realizar por comisión a los establecimientos o por comisión al viajero, pero lo más habitual en España es cobrar por comisión al alojamiento.
Los trámites que deberás realizar tendrás que consultarlos en la Consejería de Turismo (o similar) de tú comunidad autónoma y podrás optar entre darte de alta como Agencia de Viajes Minorista o Central de Reservas.  Aunque coloquialmente todo el mundo lo conozca ese servicios como Central de Reservas te recomiendo que valores la opción de optar por la figura de Agencia de Viajes Minorista.
Por útlimo, en Andalucía hay varios ejemplos de Centrales de Reservas y puedes ver cómo funcionan, entre las que puedes encontrar:
 - Rural Sierra y Sol, central de reservas especializada en casas rurales.  Identifica con   claridad al alojamiento y todas sus características
 - Alorústico, central de reservas de turismo rural.  Esconde el nombre del alojamiento y el viajero sólo conoce el nombre del alojamiento en el momento que ya ha culminado la reserva.
Además podrás encontrar otra serie de directorios o portales en Internet donde se ofrece a los alojamientos ese servicio de intermediación sin cobrar por las reservas como pueden ser:
 - Club Rural, a nivel nacional
 - Casas rurales Granada, Altipla Rural.
 - Casas Cueva, portal específico de este tipo de alojamiento.
Son ejemplos, entre otros muchos, de cómo puedes enfocar esta nueva aventura. 
Suerte.
 

Hola de nuevo,
existe alguna diferencia entre las dos figuras, pero lo más costoso de ambos trámites, que es el aval de 60.000 Euros que te exigen (así es en Andalucía) coincide en cantidad y condiciones para las dos figuras.  En el caso de la Agencia de Viajes Minorista también te exigen tener un seguro de responsabilidad civil, pero esto no es lo más costoso y, además, es recomendable en cualquier caso.
Por otro lado, si te das de alta como Agencia de Viajes Minorista On-Line (sin oficina) evitas el resto de trámites engorrosos que tiene abrir una Agencia de Viajes con oficina.
Como te decía en mi primera pregunta, mira bien esta posibilidad y valorara en función de tú caso, puesto que la Agencia de Viajes tiene la ventaja de que puedes trabajar en otros sectores, mientras que la Central de Reservas es más restrictiva.
Un saludo.

Legalmente no, si participas en el proceso de reserva tendrías que usar una de esas dos figuaras y poner el aval.
Un saludo.