Socorro problema con windows 98

Hola, espero que puedas ayudarme. Tengo varias películas copiadas(ripeadas) en el disco duro y me interesaría comprimirlas(si veo las pelis desde el disco duro con el powerdvd u otro se me ven bien). Para ello además de los codecs uso el programa Flaskmpeg(aunque he usado otros y me ha dado el mismo problema). Bueno, pues el caso es que cuando pongo este programa a comprimir los archivos de video .vob que tengo en mi disco duro cuando lleva un 5-10% aprox se me cuelga el ordenador por completo y tengo que reiniciar. Problema de los programas no puede ser porque he probado con varios así que creo que el fallo está en el windows. Teniendo abierto el Dr.Watson el error que me muestra una vez que reinicio el ordenador es algo así:"shell.dll alteró el sistema de archivos del sistema" es que no me acuerdo, lo siento pero era algo muy parecido. He probado ha cambiar las dll problemáticas al tuntún he instalado las rutinas del visualbasic6.0 y he reinstalado windows un par de veces después de que me diera este problema y todo sigue igual. En fin, si sabes o tienes alguna ligera idea de lo que puede ser pues te agradecería que me ayudaras. Muchas gracias de antemano. Toni