Urgente! Sector de arranque

Estimado(os) experto(os): Tengo un problemilla que no se resolver. Uso windows 98 como sistema operativo. El tema es que me dispuse a instalarle otro sistema operativo al ordenador y le metí y programilla de gestión de arranque. Bueno todo funciona adecuadamente pero el problema es que no se como quitarlo y que se me quede tal cual estaba. Cuando lo instale tenia tres opciones, entre ellas la opción inicial "Unknow boot" (las otras dos eran "standard boot" y "boot manager"). Pero después vuelvo al programilla y me desaparece la primera. No se si formateando el disco duro lo arreglo, aunque "creo" que no. Por favor, dime si hay alguna forma de volver a restablecerlo como lo tenia, o alguna forma de formatearlo, etc..
Agradecido de antemano.