Personalizar instalacion de aplicacion en VB2005

Estimado experto:
  Corro en vuestro auxilio para que me socorra con lo siguiente:
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Tengo hecha una aplicacion en VB2005 que toma datos de SQL2005 y
necesito que al realizar la instalacion de la misma en cada cliente,
pueda acceder al motor de base de datos. Las transacciones en las
tablas (altas, bajas, etc) se hacen a traves de procedimientos
almacenados que estan en el motor. La pregunta es como hago para que se
personalice a traves de la instalacion indicando el nombre del motor de
datos que quiero utilizar y el nombre de la BD?. Existe en VS alguna
forma de indicarlo.
Si le sirve por ejemplo para traer datos de una tabla hago esto:
dim ds as dataset = new dataset
ds = program.data.executedataset("MostrarClientes")
- Tendria algun ejemplo de publicacion de la aplicacion?

Una aclaracion:
al generar el instalador y realizar la instalacion solo me copia archivos y entre ellos no esta el app.config. Como hago para que me aparezca y lo edite?. Se que en la carpeta de la solucion esta el archivo pero esto es en el fuente de la aplicacion. No hay forma de que el usuario realice la instalacion solamente indicando los nombres del motor y BD?

Bien. Una respuesta aceptable.