Problemas al pegar subtitulos

Hola mickeyex, siento que la pregunta sea tan larga pero prefiero darte todos los datos posibles para evitar el tener que seguir preguntando o liarte más, empiezo:
Tengo una película en formato avi y tengo los subtitulos de dicha película en formato srt, estoy intentando pegar los subtitulos a la película para poder verla en el reproductor de sobremesa, es decir que no es para verla en el ordenador, esta operación ya la he hecho antes con otras películas y hasta ahora no había tenido problemas, pero en esta ocasión he utilizado el subtitle workshop para pasar los subtitulos a ssa y al volver a comprimir la película con el virtual dub se ven los subtitulos pero demasiado bajos, de forma que cuando hay 2 lineas de subtitulos la de más abajo no se lee.
He intentado pasar el srt a ssa con el subtitle tool, y entonces al "pasar" la peli por el virtual dub se ven perfectos los subtitulos pero desfasados, si intento ajustar el desfase con el workshop me lo corrige pero me vuelve a bajar los subtitulos.
En fin no se si me he explicado bien, en definitiva quiero saber como subir las lineas o como ajustar el desfase con el virtual dub.
Gracias por tu ayuda.