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ok, gracias por lo dicho y mil disculpas por no haberte respondido antes, te comentare que yo tengo un sistema con 6 000 000 de registros, trabaja muy bien pero eso si todo va depender de la configuracion de tu php.ini donde debes cambiar cargos algunos valores para que tus script duren mas, otra cosa es ver que tus consultas deben estar depuradas al maximo para que se ejecuten rapidamente, debes de crear indices en todas las tablas e indices con los campos mas utilizados te ayudaran 1000%, cuando tengas que trabajar con muchas data pero pocos campos utiliza tablas temporales, siempre es bueno utilizar las versiones finales cuando dejan de ser beta, yo uso aun el 4.1.11 , acerca de los manuales debes de tener algunas ayudas aqui te paso una pagina muy buena para mysql mysql.conclase.net/, pero te recomiendo tener la ayuda del mysql:
http://www.hospedajeydominios.com/mambo/documentacion-manual_mysql.html
http://dev.mysql.com/doc/
pero aprende a dominar las consultas y comandos basicos y cuadno quieras construir tus consultas empieza de menos a mas poco a poco hasta que la cosnulta te de lo que tu gustes, pero recuerda de menos a ams porque si buscas directamente lo que qiiers puede ser muy frustante cuando no te sale, espero me comnetes como te fue
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