Sacar muela del juicio antes o despues de ortodoncia?

Hola
Mi pregunta es que estoy pensando en ponerme ortodoncia. Dentro de poco empezaré. De momento he estado mirando en distintos sitios, y cada uno me ha dicho una respuesta distinta.
Las 2 muelas del juicio de abajo, han salido pero no del todo. Sobre todo la derecha, es que está como oscura, como si estubiera dañada.  Un dentista me dijo que si, que me las sacara. Otro que no, que mejor no tocarlas y dejarlas ahi, que no afectaría al aparato, que si eso me las sacara despues?
Estoy echa un lio, mi pregunta es si cree que me tendría que sacar las muelas del juicio de abajo? Si debo sacarmelas es mejor antes o despues de la ortodoncia? No tengo molestias, la derecha alguna vez, se inflama, pero luego se pasa. Aunque el tema de que esté asi como oscura no me hace mucha gracia.
Yo pienso que si me las saco después de la ortodoncia, afectara a los dientes que se moveran.  Muchas gracias, espero impaciente su respuesta.

Hola
Así que me aconseja sacarme las muelas y antes del aparato.
La opcion de no sacarmelas no me la aconseja no? (yo si no fuera por el tema del aparato no me las quitaria, porque ya llevo años con las muelas así)
Me da un poco de miedo, porque son delicadas, y seguro que como no están fuera del todo, tendrán que ser con cirujía, con puntos, me asusta que me toquen algun nervio.
Cree que el dentista se querrá esperar hasta que me las saque para ponerme el aparato? Porque lo haria por el seguro e igual me dan para meses. 

Muchas gracias por sus respuestas, me quedo más tranquila. Me ha sido de mucha ayuda, ahora solo espero no tener que esperar mucho por la seguridad social, y que la dentista, se espere hasta que me las quiten.