Reducción de jornada seguida de baja por lumbalgia

Voy a explicarme mejor, en la actualidad estoy embarazada de 6 meses y medio y estoy disfrutando de reduccion de jornada por otra niña que tiene 18 meses. La reducción de jornada la tengo solicitada hasta el 30 de septiembre con lo cual en octubre volveré a mi jornada habitual, lo cual temo porque ya noto molestias en la zona lumbar que seguro que con el doble de trabajo iran a más, por eso estoy pensando en pedir la baja cuando se me termine la reduccion de jornada. Mi duda es ¿cuando esté de baja cobraré según el sueldo con jornada reducida aunque ya se haya terminado??????
Un saludo y gracias de antemano.

Gracias, ya me he aclarado.
Un saludo