amigo... directamente desde windows no conozco manera alguna, pero hay una aplicacion buenisima, que te permite ocultar y bloquera carpetas....
http://folder-lock.malavida.com/mvdwn/es/1468
en esat direccion lo puedes descargar.... pero ten cuidado... es poderoso... y si olvidas las contraseñas aplicadas a alguna carpeta... no podras recuperarlas...